異地公司之間的合同糾紛一般可以通過以下步驟進行起訴：

1. 確認合同地域管轄：首先需要查看合同中的法律選擇和爭議解決條款，以確定合同應適用的法律和解決爭議的地點。如果合同中沒有明確規(guī)定，一般會根據(jù)涉案金額和爭議的性質來確定合適的法院管轄。

2. 咨詢律師：在起訴之前，建議咨詢專業(yè)律師，了解相關法律程序和證據(jù)要求。律師可以幫助評估案件的可行性，并提供具體的法律意見和建議。

3. 準備訴訟材料：起訴之前，需要準備起訴狀以及相關證據(jù)和證人證言。起訴狀應包括事實陳述、法律依據(jù)、請求和證據(jù)清單等。證據(jù)可以包括合同、相關郵件、聊天記錄、支付憑證等，以證明對方違反了合同約定。證人證言可以進一步支持自己的主張。

4. 提起訴訟：根據(jù)合同管轄權確定相關法院，將訴訟材料遞交給法院，并按照法院要求繳納訴訟費用。法院會進行立案并通知對方，正式啟動訴訟程序。

5. 庭前準備：在庭前準備階段，法院可能安排雙方進行調解，協(xié)商解決爭議。如果調解不成功，法院會組織庭前會議，討論爭議焦點、證據(jù)和可能的調查程序，并制定進一步的庭前程序安排。

6. 庭審和判決：如果庭前程序沒有解決爭議，法院會安排庭審。雙方當事人可以提出證據(jù)并進行辯論，法院會根據(jù)證據(jù)和法律規(guī)定進行裁決。根據(jù)審判程序和實際情況，法院可能會進行一審、二審和終審等多個階段的審理。

7. 執(zhí)行判決：如果判決對方有違約責任，但對方不履行判決，你可以申請執(zhí)行。法院會根據(jù)申請，對對方的財產(chǎn)進行查封、扣押或拍賣，以執(zhí)行判決。

總之，在異地公司之間的合同糾紛中，起訴需要根據(jù)合同約定選擇合適的法院，并按照法院的規(guī)定和程序提供相關證據(jù)和請求。與對方和法院進行充分的溝通和協(xié)商，以解決爭議或獲得合理的賠償。如有需要，建議尋求合格律師的幫助，以確保整個訴訟過程的順利進行。