監(jiān)理單位在管理合同糾紛時可以采取以下措施：

1. 做好合同管理：監(jiān)理單位應該具備豐富的合同管理經(jīng)驗，要確保合同條款清晰明確，合同簽訂和執(zhí)行過程中的各項事項一一記錄并保存。同時，監(jiān)理單位還應該對項目實施過程進行全面監(jiān)控，確保各方履行合同責任。

2. 加強溝通與協(xié)調：監(jiān)理單位應該積極與相關各方進行溝通，及時了解各方的意見和需求，及時解決合同糾紛可能出現(xiàn)的矛盾和問題。在合同糾紛中，監(jiān)理單位可以積極擔當調解角色，促使各方達成共識，盡量避免糾紛升級。

3. 做好證據(jù)保全：監(jiān)理單位應該及時收集、保存與合同糾紛相關的證據(jù)，包括合同文件、項目實施過程的相關記錄、證人證言等。這些證據(jù)將有助于監(jiān)理單位在合同糾紛中闡述自己的觀點和證明自己的合法權益。

4. 尋求法律支持：如果合同糾紛無法通過協(xié)商解決，監(jiān)理單位可以尋求法律支持，包括咨詢專業(yè)律師、請求相關機構進行調解、或者通過訴訟等法律手段解決糾紛。監(jiān)理單位應該了解相關法律法規(guī)，并根據(jù)法律程序和要求進行操作。

5. 避免違法行為：監(jiān)理單位在管理合同糾紛時應該始終遵守法律法規(guī)，不得使用違法手段解決問題。監(jiān)理單位應根據(jù)合同約定和相關法律規(guī)定，采取合法、合理的方式解決合同糾紛，保護自身合法權益的同時，也要充分考慮項目實施進度、工程質量等因素。

綜上所述，監(jiān)理單位在管理合同糾紛時需要具備一定的專業(yè)知識和法律意識，將合同管理、溝通協(xié)調、證據(jù)保全、法律支持等措施結合起來，合理處理合同糾紛，保障自身權益的同時，也維護項目實施的順利進行。