借款合同糾紛的管轄法院主要由以下幾個因素決定：

1. 合同約定：合同雙方可以在合同中約定爭議解決方式和管轄法院。如果在合同中明確規(guī)定了管轄法院，那么雙方應當按照合同約定的方式去解決爭議。

2. 物權糾紛管轄規(guī)定：如果借款合同糾紛涉及到不動產的轉讓或抵押擔保等，那么根據《中華人民共和國物權法》的規(guī)定，應當按照不動產所在地人民法院的管轄權限進行處理。

3. 借款合同糾紛性質：根據《中華人民共和國民事訴訟法》的規(guī)定，借款合同糾紛屬于民事糾紛范疇。一般而言，按照最高人民法院的規(guī)定，借款合同糾紛該由借款人所在地或借款合同約定的履行地人民法院管轄。

4. 選擇權原則：如果雙方沒有在合同中約定，則可以根據被告住所地或者合同履行地所在地的基層人民法院管轄，或者根據原告住所地所在地的基層人民法院管轄。

總體來說，借款合同糾紛的管轄法院以合同約定為最優(yōu)先考慮條件，其次根據權益保護需要、被告住所地或合同履行地所在地、原告住所地所在地等因素確定。在實際操作中，應當根據具體情況，與律師進行溝通，并參照相關法律法規(guī)和司法解釋進行判斷。