運輸合同糾紛的起訴流程一般包括以下幾個步驟：

1.起訴狀的準備：當發(fā)生運輸合同糾紛時，被告違反了合同約定或者未履行合同義務(wù)，起訴方可以向人民法院提起訴訟。起訴方需要準備好起訴狀，其中應(yīng)包括訴訟請求、事實和理由、證據(jù)和法律依據(jù)等內(nèi)容。

2.提起訴訟：起訴方需要將起訴狀提交給被告所在地或者合同履行地的人民法院，并按照法院的相關(guān)規(guī)定繳納案件受理費。

3.立案受理：法院在收到起訴狀后，會對起訴狀進行審查，審核訴訟材料是否齊全、符合法律規(guī)定。如果符合要求，法院會立案受理，并發(fā)出立案通知書。

4.開庭準備：當法院受理案件后，會通知雙方當事人、負責人或代理人參加庭前調(diào)解或開庭審理。雙方應(yīng)準備好相關(guān)證據(jù)材料，并提前了解相關(guān)的法律法規(guī)和爭議焦點，以便在庭審中進行合理的辯論和辯護。

5.庭審：在庭審中，雙方當事人需要向法院提供證據(jù)，法官會質(zhì)詢雙方并聽取雙方的陳述和辯論。雙方可以就爭議焦點爭辯并提出證據(jù)材料。庭審過程中，法院還可以進行調(diào)解，希望雙方能夠達成和解協(xié)議。

6.判決或調(diào)解：經(jīng)過庭審后，法院會根據(jù)合同約定、法律法規(guī)以及爭議的事實和證據(jù)，做出判決或調(diào)解決定。判決或調(diào)解決定具有法律效力，雙方當事人應(yīng)當按照判決或調(diào)解決定的內(nèi)容履行相關(guān)義務(wù)。

7.上訴：如果對法院的判決或調(diào)解決定不服，任一方當事人可以在規(guī)定的上訴期限內(nèi)向上級法院提起上訴。

總之，運輸合同糾紛的起訴流程需要起訴方根據(jù)法律程序提供充分的證據(jù)和依據(jù)，經(jīng)過法院的受理、庭審和最終的判決或調(diào)解，以實現(xiàn)自己的合法權(quán)益。