如果廠房沒有房產(chǎn)證，需要進行拆遷的情況下，賠償企業(yè)的方式可以根據(jù)具體情況采取如下幾種方式：

1. 協(xié)商補償：政府和企業(yè)可以通過協(xié)商的方式確定賠償金額以及賠償方式，如提供其他廠房的替代物或者給予一定的金錢補償?shù)取?/p>

2. 重新分配：如果企業(yè)是占用政府土地建設(shè)的，政府可以重新分配相同或相似的土地給企業(yè)，并進行相應(yīng)的賠償。

3. 轉(zhuǎn)讓土地使用權(quán)：政府可以在拆遷的同時，將原先的土地使用權(quán)轉(zhuǎn)讓給企業(yè)，使企業(yè)能夠繼續(xù)在拆遷后的土地上進行經(jīng)營，并給予一定的經(jīng)濟補償。

4. 重新安置：如果企業(yè)沒有合適的臨時場所或者經(jīng)濟條件不允許繼續(xù)經(jīng)營，政府可以協(xié)助企業(yè)進行重新安置，提供其他廠房或土地，并給予相應(yīng)的補償。

5. 訴訟索賠：如果企業(yè)認為賠償金額不合理或者賠償方式不公平，可以通過訴訟的方式來維護自己的權(quán)益，請求法院進行公正的賠償判決。

需要注意的是，在拆遷過程中，雙方需保持溝通和談判，以達到雙方的利益平衡。同時，企業(yè)也需要保留相關(guān)的證據(jù)和合同等文件，以便在需要時提供證據(jù)進行維權(quán)。