農(nóng)村拆遷中商店的賠償是一個涉及到權(quán)益保護和公平公正問題的復(fù)雜過程。根據(jù)《城市房屋征收與補償條例》的規(guī)定，拆遷補償應(yīng)當依法進行，保護被拆遷人合法權(quán)益，確保其基本生活權(quán)和合理發(fā)展權(quán)。

首先，對于拆遷商店的賠償，應(yīng)當考慮到商店的經(jīng)營期限和經(jīng)濟狀況。一般情況下，商店的賠償包括以下方面：

1. 補償費用：商店的拆遷補償費用應(yīng)當包括商店房屋及其他固定資產(chǎn)的市場價值、未來幾年的經(jīng)濟損失及其他合理費用。商店的經(jīng)營時間越長、經(jīng)濟狀況越好，其補償費用應(yīng)當相應(yīng)增加。

2. 營業(yè)額和租金補償：商店作為一種經(jīng)營實體，其經(jīng)營活動直接與商店主的生計息息相關(guān)。因此，在拆遷過程中，商店的經(jīng)營活動受到的影響應(yīng)當?shù)玫较鄳?yīng)的補償。其中包括商店的營業(yè)額和租金的補償。

3. 就業(yè)安置：商店的拆遷也會對商店員工的就業(yè)產(chǎn)生一定的影響。在拆遷過程中，應(yīng)當考慮員工的就業(yè)安置問題，如提供崗位轉(zhuǎn)移或職業(yè)培訓(xùn)等。

4. 社會保障：商店的拆遷還會牽涉到商店主在拆遷后的生活保障。因此，在賠償中，應(yīng)當考慮商店主的社會保障問題，如養(yǎng)老保險、醫(yī)療保險等。

需要注意的是，農(nóng)村拆遷中商店的賠償標準和履行程序應(yīng)當遵循相關(guān)法律法規(guī)的規(guī)定，并確保公平公正。同時，政府和拆遷承辦方應(yīng)當積極與商店主進行溝通和協(xié)商，聽取其意見和需求，并盡量保證賠償安置政策的透明、可行性和可操作性。

總之，農(nóng)村拆遷中商店的賠償應(yīng)當采取因地制宜的方式，綜合考慮商店主的經(jīng)濟狀況、權(quán)益保護和發(fā)展需要，確保其合法權(quán)益得到充分的保護和妥善的安置。同時，政府和社會各界也應(yīng)當加強對農(nóng)村拆遷補償政策的監(jiān)督和評估，及時糾正不合理的賠償現(xiàn)象，推動拆遷補償制度的長期健康發(fā)展。