處理別墅房產糾紛首先要了解糾紛的具體情況，包括糾紛的起因、雙方的主張和證據(jù)等。然后，可以通過以下方式處理糾紛：

1. 協(xié)商解決：雙方可以通過面對面或書面協(xié)商，尋求達成一致的解決方案，例如重新確定權益、調整分配比例等。

2. 法律申訴：如果協(xié)商無法解決，可以向相關的法院提起訴訟。在申訴過程中，需要準備充分的證據(jù)，如合同、收據(jù)、房屋產權證等，以支持自己的主張。

3. 調解仲裁：如果雙方同意，可以選擇通過調解或仲裁解決糾紛。調解或仲裁過程中，雙方可以由第三方專業(yè)機構或人士進行公正的調解和仲裁，以達到公正解決糾紛的目的。

4. 尋求專業(yè)幫助：如果自己不熟悉法律程序或實力不夠強大，可以尋求專業(yè)的律師幫助，代理自己的利益，提供專業(yè)的法律意見。

無論采取哪種方式處理房產糾紛，最重要的是要保持冷靜，理性對待問題，充分了解自己的權益和法律規(guī)定，爭取自己的合法權益。