公司股東出資糾紛可以通過以下方式進行處理：

1. 協商解決：股東可以通過溝通和協商來解決糾紛?？梢赃x擇召開股東會議或委托調解專業(yè)機構進行調解，協商達成雙方都能接受的解決方案。

2. 法律途徑：如果協商無效，股東可以選擇通過法律途徑解決糾紛。可以請律師提起訴訟，依法維護自己的權益。

3. 仲裁：雙方可以選擇通過仲裁來解決糾紛。仲裁是一種非訴訟程序，由具有專業(yè)資格的仲裁員進行公正裁決，雙方都要遵守裁決結果。

4. 股東協議：在公司成立或投資時，可以制定詳細的股東協議，明確股權關系、出資方式、糾紛解決機制等，以避免或減少糾紛的發(fā)生。

無論采取何種方式解決糾紛，都應盡量保持冷靜和理智，確保合理權益的維護，維護公司的穩(wěn)定和發(fā)展。